Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TTF1Q15361 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TTF1Q15361 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TTF1Q15361 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TTF1Q15361 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TTF1Q15361 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TTF1Q15361 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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