Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms