Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIXQ14938 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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