Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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CHD4Q14839 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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CHD4Q14839 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHD4Q14839 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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