Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms