Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE1CQ14123 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PDE1CQ14123 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201 ms