Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H3Q13889 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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