Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SPTAN1Q13813 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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