Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms