| RUNX3 | Q13761 | SNORD48-201 | ENST00000364953 | 64 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-926P-201 | ENST00000384075 | 107 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-793P-201 | ENST00000384233 | 104 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNY3P4-201 | ENST00000384428 | 101 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA67.6-201 | ENST00000391093 | 99 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPS-201 | ENST00000398023 | 270 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL033519.2-201 | ENST00000403958 | 392 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1287-201 | ENST00000408492 | 90 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113618.1-201 | ENST00000416747 | 285 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC123900.1-201 | ENST00000420390 | 96 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX510359.4-201 | ENST00000423750 | 193 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010531.2-201 | ENST00000465012 | 153 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC055731.1-201 | ENST00000474387 | 401 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL26P26-201 | ENST00000480251 | 434 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-911P-201 | ENST00000516523 | 104 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4719-201 | ENST00000585233 | 84 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL109918.3-201 | ENST00000603072 | 338 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX248123.2-201 | ENST00000606318 | 124 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PART1_1.1-201 | ENST00000611761 | 217 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MALAT1-207 | ENST00000613376 | 132 nt | TSL 3 BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-62P-201 | ENST00000362599 | 164 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.179-201 | ENST00000363844 | 90 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-280P-201 | ENST00000364145 | 104 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.527-201 | ENST00000384573 | 102 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MIR1283-2-201 | ENST00000408621 | 87 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD12B-201 | ENST00000410433 | 91 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-130P-201 | ENST00000411112 | 103 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELOCP21-201 | ENST00000412558 | 336 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004965.1-201 | ENST00000413033 | 213 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC121342.1-201 | ENST00000423914 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016717.1-201 | ENST00000448918 | 286 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009474.2-201 | ENST00000451383 | 136 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPS17P9-201 | ENST00000511924 | 393 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA25.10-201 | ENST00000515926 | 124 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCARNA15.1-201 | ENST00000516384 | 125 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.683-201 | ENST00000516508 | 93 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA40.14-201 | ENST00000516543 | 86 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1012P-201 | ENST00000516606 | 109 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP49-201 | ENST00000516675 | 260 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP364-201 | ENST00000516938 | 78 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-19P-201 | ENST00000517288 | 84 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-988P-201 | ENST00000519081 | 107 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091144.1-201 | ENST00000519573 | 138 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSBP1P1-201 | ENST00000555205 | 166 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC055872.1-201 | ENST00000570978 | 278 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD11B-201 | ENST00000607707 | 90 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL021879.1-201 | ENST00000611756 | 288 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DSCR8-208 | ENST00000614538 | 403 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR8070-201 | ENST00000616510 | 88 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GNAS-AS1_4.1-201 | ENST00000616546 | 112 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068205.3-201 | ENST00000636385 | 468 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VPS13A-206 | ENST00000376646 | 2262 nt | TSL 5 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011124.2-201 | ENST00000518739 | 3222 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.27-201 | ENST00000362540 | 103 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-961P-201 | ENST00000363893 | 105 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD114-6-201 | ENST00000364393 | 72 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1026P-201 | ENST00000384465 | 108 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR586-201 | ENST00000385035 | 97 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR548B-201 | ENST00000385247 | 97 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-823P-201 | ENST00000391042 | 103 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR300-201 | ENST00000401138 | 83 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P44-201 | ENST00000441935 | 243 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007395.1-201 | ENST00000451333 | 677 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL274P-201 | ENST00000492268 | 272 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA40.9-201 | ENST00000515895 | 93 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-475P-201 | ENST00000516073 | 104 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC040926.1-201 | ENST00000530195 | 238 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113192.4-201 | ENST00000534666 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015720.1-201 | ENST00000565251 | 277 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024614.2-201 | ENST00000577584 | 372 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02104-202 | ENST00000604954 | 599 nt | TSL 3 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLEU2_2.2-201 | ENST00000615474 | 90 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | hsa-mir-548d-1.1-201 | ENST00000636914 | 97 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BCL2L11-225 | ENST00000640419 | 249 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC9C2-201 | ENST00000367714 | 4428 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA1107-201 | ENST00000370378 | 4622 nt | TSL 5 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL42-202 | ENST00000393128 | 1983 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02555-201 | ENST00000563933 | 1951 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZBBX-205 | ENST00000455345 | 3185 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL391987.6-201 | ENST00000305671 | 199 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD115-3-201 | ENST00000363100 | 82 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.153-201 | ENST00000363615 | 91 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1305P-201 | ENST00000364353 | 104 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-438P-201 | ENST00000365561 | 103 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-418P-201 | ENST00000384035 | 107 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA40.19-201 | ENST00000390846 | 128 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139712.2-201 | ENST00000424302 | 339 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z68323.1-201 | ENST00000450365 | 519 nt | TSL 3 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02514-201 | ENST00000509058 | 498 nt | TSL 3 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-966P-201 | ENST00000516479 | 104 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4529-201 | ENST00000578110 | 78 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357054.2-201 | ENST00000607644 | 423 nt | TSL 5 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.812-201 | ENST00000610788 | 101 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |