Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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