Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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