Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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MKRN4PQ13434 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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MKRN4PQ13434 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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