Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SRSF5Q13243 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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