Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
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