Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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