Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms