Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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