Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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GPS1Q13098 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPS1Q13098 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
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GPS1Q13098 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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GPS1Q13098 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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GPS1Q13098 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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