Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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