Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms