Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
STX4Q12846 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
STX4Q12846 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
STX4Q12846 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
STX4Q12846 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms