Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGXB3Q12766 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGXB3Q12766 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGXB3Q12766 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms