Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PGGT1BP53609 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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