Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPRCP08575 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPRCP08575 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRCP08575 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRCP08575 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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