Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LRRTM2O43300 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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