Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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