Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms