Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERGIC2Q96RQ1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms