Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC93Q567U6 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC93Q567U6 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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