Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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ANKRD39Q53RE8 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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ANKRD39Q53RE8 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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ANKRD39Q53RE8 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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ANKRD39Q53RE8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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ANKRD39Q53RE8 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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ANKRD39Q53RE8 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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ANKRD39Q53RE8 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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