Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTXN3Q4LDR2 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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