Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRNQ16849 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms