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| MAPKAPK3 | Q16644 | AC100807.1-201 | ENST00000517640 | 552 nt | TSL 5 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AP003715.1-201 | ENST00000532109 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR3684-201 | ENST00000579779 | 74 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AP001178.1-201 | ENST00000584679 | 268 nt | TSL 3 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR376A1-201 | ENST00000616574 | 68 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL590808.1-201 | ENST00000618696 | 141 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | MCMDC2-207 | ENST00000492775 | 1831 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CYLC2-204 | ENST00000612124 | 1817 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | RGPD6-201 | ENST00000329516 | 7165 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SKIL-202 | ENST00000413427 | 2702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | PTPN22-203 | ENST00000460620 | 1794 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.19-201 | ENST00000362462 | 99 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-155P-201 | ENST00000516347 | 100 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-635P-201 | ENST00000516651 | 102 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | AC112481.1-201 | ENST00000549669 | 901 nt | TSL 2 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC084882.1-201 | ENST00000561254 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC092138.2-201 | ENST00000563811 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR4529-201 | ENST00000578110 | 78 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC022441.3-201 | ENST00000605737 | 136 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC067747.1-201 | ENST00000608026 | 250 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Clostridiales-1.3-201 | ENST00000637703 | 147 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CALCRL-201 | ENST00000392370 | 5155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SENP7-205 | ENST00000394091 | 4434 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | PCDH11Y-203 | ENST00000362095 | 4220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RPL21P1-201 | ENST00000399532 | 476 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MRLN-201 | ENST00000414264 | 422 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | HMGN2P3-201 | ENST00000433603 | 273 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | HMGN2P5-201 | ENST00000436882 | 273 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | HMGN2P34-201 | ENST00000437647 | 269 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL353689.1-201 | ENST00000438895 | 199 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC008080.3-201 | ENST00000440074 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC003988.1-201 | ENST00000447198 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AP001001.1-201 | ENST00000532422 | 826 nt | TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR4300-201 | ENST00000581016 | 96 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC008749.1-201 | ENST00000597650 | 306 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.15-201 | ENST00000611544 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.16-201 | ENST00000613119 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.12-201 | ENST00000613778 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.20-201 | ENST00000613956 | 192 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.9-201 | ENST00000615427 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.2-201 | ENST00000616535 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.3-201 | ENST00000617785 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU2-1-201 | ENST00000618664 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.6-201 | ENST00000619225 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.5-201 | ENST00000619465 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U2.10-201 | ENST00000620268 | 191 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U6.115-201 | ENST00000636045 | 103 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-238P-201 | ENST00000363313 | 106 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.331-201 | ENST00000365267 | 102 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR518C-201 | ENST00000384822 | 101 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-1109P-201 | ENST00000391187 | 107 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR1283-2-201 | ENST00000408621 | 87 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU4-30P-201 | ENST00000410245 | 143 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.602-201 | ENST00000410535 | 92 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC005042.3-201 | ENST00000453230 | 174 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | LINC01399-202 | ENST00000458450 | 244 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORD65B-201 | ENST00000459126 | 73 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RPS27P21-201 | ENST00000486977 | 252 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |