Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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