Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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