Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CCDC6Q16204 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC6Q16204 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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