Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALX1Q15699 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms