Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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ZNHIT3Q15649 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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ZNHIT3Q15649 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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ZNHIT3Q15649 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNHIT3Q15649 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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