Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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