Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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