Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
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SYCP1Q15431 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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SYCP1Q15431 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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SYCP1Q15431 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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SYCP1Q15431 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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SYCP1Q15431 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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SYCP1Q15431 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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SYCP1Q15431 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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