Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms