Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms