Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
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BRD3Q15059 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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BRD3Q15059 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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BRD3Q15059 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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BRD3Q15059 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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BRD3Q15059 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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BRD3Q15059 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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BRD3Q15059 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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