Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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