Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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