Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB39AQ14964 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RAB39AQ14964 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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