Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3AQ14563 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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