Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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