Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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CKAP5Q14008 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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